Это у вас в конкретном вашем телефоне беда. У меня после обновления на 3.1 как отпечаток стал шустрее, так и распознавание за доли секунды. Рекомендую сделать резервную копию через смартсвитч и сбросить настройки телефона до заводских с последующим восстановлением зарезервированных данных.