Поскольку 99% времени я пользуюсь одной из разновидностей Linux, то кастомизация там изначально )) Ставишь какую-нибудь Gentoo или LFS и из исходников компилируешь себе только то, что хочешь сам - от ядра, до софта и под свою систему (остальные драйвера можно из ядра выкинуть) - вот где глубокая кастомизация.
Макось штука деревянная, кастомизации ничем не поддаётся А в случае винды радуюсь что сама система хотя бы в принципе запускаетя, там и без программ-настройщиков всё хрупкое, от малейшего чиха сдохнуть может. Не рискую что-то подобное запускать.